إطار القراءة المفتوح عكس الاتجاه

إطار القراءة المفتوح عكس الاتجاه واختصارا (يوأورف: uORF) هو إطار قراءة مفتوح يقع في المنطقة غير المترجمة 5' من الرنا الرسول الخاص بحقيقيات النوى (عكس الاتجاه بالنسبة لإطار القراءة المفتوح الرئيسي) ويقوم بتنظيم ترجمة إطار القراءة المفتوح الرئيسي للرنا الرسول، غالبا بتثبيط ترجمته.^[1] توجد حالات قليلة (مثل جين Gcn4 لدى الخميرة) يقوم فيها اليوأورف بتعزيز ترجمة إطار القراة المفتوح الرئيسي.^[2]^[3]

يُعرّف اليوأورف على أنه تسلسل يبدأ بكودون بدء في المنطقة غير المترجمة 5' وينتهي بكودون توقف في الإطار (في نفس إطار القراءة) قبل نهاية تسلسل إطار القراءة المفتوح الرئيسي ويبلغ طوله على الأقل 9 نوكليوتيدات بما في ذلك كودون التوقف.^[4] حوالي 50% من الجينات البشرية تملك يوأورفا في المنطقة غير المترجمة 5' ومعظمها يثبط ترجمة إطار القراءة المفتوح الرئيسي، وتملك بعض الجينات أكثر من يوأورف واحد.^[5] تخفض اليوأورفات التعبير عن البروتين بنسبة 30-80% مع تأثير صغير على مستويات الرنا الرسول، وهي متعددة الأشكال ^[English] ويسبب تطفرها أمراضا للإنسان ويُخفض بشكل كبير التعبير عن إطاراتها المفتوحة الرئيسية.^[4]

تسمى نواتج ترجمة اليوأورفات بالميكروببتيدات ويمكن تميزها عن المحتوى الخلوي بواسطة مطيافية الكتلة،^[6] ويشارك بعضها في تنظيم الترجمة أو الارتباط ببروتينات أخرى في الخلية والتأثير على مسارات أخرى.^[5]

مراجع

^ Hinnebusch, Alan G. (29 Aug 1997). "Translational Regulation of Yeast GCN4: A WINDOW ON FACTORS THAT CONTROL INITIATOR-tRNA BINDING TO THE RIBOSOME *". Journal of Biological Chemistry (بEnglish). 272 (35): 21661–21664. DOI:10.1074/jbc.272.35.21661. ISSN:0021-9258. PMID:9268289. Archived from the original on 2022-07-12.
^ Vilela C، McCarthy JE (أغسطس 2003). "Regulation of fungal gene expression via short open reading frames in the mRNA 5'untranslated region". Molecular Microbiology. ج. 49 ع. 4: 859–67. DOI:10.1046/j.1365-2958.2003.03622.x. PMID:12890013.
^ Lovett PS، Rogers EJ (يونيو 1996). "Ribosome regulation by the nascent peptide". Microbiological Reviews. ج. 60 ع. 2: 366–85. DOI:10.1128/MMBR.60.2.366-385.1996. PMC:239448. PMID:8801438.
^ ^أ ^ب Calvo SE، Pagliarini DJ، Mootha VK (2009). "Upstream open reading frames cause widespread reduction of protein expression and are polymorphic among humans". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Proceedings of the National Academy of Sciences. ج. 106 ع. 18: 7507–12. Bibcode:2009PNAS..106.7507C. DOI:10.1073/pnas.0810916106. PMC:2669787. PMID:19372376. مؤرشف من الأصل (PDF) في 2022-01-20.
^ ^أ ^ب Joana SilvaRafael FernandesLuísa Romão (2019). "Translational Regulation by Upstream Open Reading Frames and Human Diseases". The mRNA Metabolism in Human Disease. Springer, Cham. ص. 99-116. DOI:10.1007/978-3-030-19966-1_5. ISBN:978-3-030-19965-4. مؤرشف من الأصل في 2022-03-05. اطلع عليه بتاريخ 2021-12-02.
^ Slavoff SA، Mitchell AJ، Schwaid AG، Cabili MN، Ma J، Levin JZ، Karger AD، Budnik BA، Rinn JL، Saghatelian A (2013). "Peptidomic discovery of short open reading frame-encoded peptides in human cells". Nature Chemical Biology. ج. 9 ع. 1: 59–64. DOI:10.1038/nchembio.1120. PMC:3625679. PMID:23160002.

هذه بذرة مقالة عن علم الأحياء الخلوي والجزيئي بحاجة للتوسيع. فضلًا شارك في تحريرها.

[1] Hinnebusch, Alan G. (29 Aug 1997). "Translational Regulation of Yeast GCN4: A WINDOW ON FACTORS THAT CONTROL INITIATOR-tRNA BINDING TO THE RIBOSOME *". Journal of Biological Chemistry (بEnglish). 272 (35): 21661–21664. DOI:10.1074/jbc.272.35.21661. ISSN:0021-9258. PMID:9268289. Archived from the original on 2022-07-12.

[2] Vilela C، McCarthy JE (أغسطس 2003). "Regulation of fungal gene expression via short open reading frames in the mRNA 5'untranslated region". Molecular Microbiology. ج. 49 ع. 4: 859–67. DOI:10.1046/j.1365-2958.2003.03622.x. PMID:12890013.

[3] Lovett PS، Rogers EJ (يونيو 1996). "Ribosome regulation by the nascent peptide". Microbiological Reviews. ج. 60 ع. 2: 366–85. DOI:10.1128/MMBR.60.2.366-385.1996. PMC:239448. PMID:8801438.

[Calvo_Pagliarini_Mootha_pp._7507–7512-4] أ ^ب Calvo SE، Pagliarini DJ، Mootha VK (2009). "Upstream open reading frames cause widespread reduction of protein expression and are polymorphic among humans". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Proceedings of the National Academy of Sciences. ج. 106 ع. 18: 7507–12. Bibcode:2009PNAS..106.7507C. DOI:10.1073/pnas.0810916106. PMC:2669787. PMID:19372376. مؤرشف من الأصل (PDF) في 2022-01-20.

[Springer-5] أ ^ب Joana SilvaRafael FernandesLuísa Romão (2019). "Translational Regulation by Upstream Open Reading Frames and Human Diseases". The mRNA Metabolism in Human Disease. Springer, Cham. ص. 99-116. DOI:10.1007/978-3-030-19966-1_5. ISBN:978-3-030-19965-4. مؤرشف من الأصل في 2022-03-05. اطلع عليه بتاريخ 2021-12-02.

[6] Slavoff SA، Mitchell AJ، Schwaid AG، Cabili MN، Ma J، Levin JZ، Karger AD، Budnik BA، Rinn JL، Saghatelian A (2013). "Peptidomic discovery of short open reading frame-encoded peptides in human cells". Nature Chemical Biology. ج. 9 ع. 1: 59–64. DOI:10.1038/nchembio.1120. PMC:3625679. PMID:23160002.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]