مصيدة جينية

المصيدة الجينية هي نهج عالي الإنتاجية يُستخدم لإدخال طفرات مُدرَجة عبر جينوم كائن حي.

أسلوب

يتم تنفيذ الاصطفاف باستخدام متجهات المصيدة الجينية التي يكون العنصر الرئيسي فيها عبارة عن شريط مصيدة جينية يتكون من جين تقريري بدون مُحَفِّز نسخ (مُرَوِّن ناقص) و/أو علامة جينية قابلة للاختيار، مُحاطة بموقع انصهار 3' العلوي (مُقَبِل ناقص) ومتتابعة بمتتالية إنهاء النسخ الوظيفي (متتالية تذييل بعديد الأدينيلات؛ بولي أ) في الاتجاه القريب من الجين المستهدف.

عندما يُدرَج شريط المصيدة الجينية في إنترون لجين معرب عنه، يتم نسخ الشريط من المُشَغِّل الطبيعي لذلك الجين بصورة نسخة اندماج يتم فيها تقسيم الإكسون في المنبع من موقع الإدخال في إطار إلى جين المراسل/علامة جينية قابلة للاختيار كجزء من متحول النسخ الذي يُتَرَجِّم في شكل تسلسل دمجي حيث يُنصهر جين الجينات التي تقع قبل موقع الإدراج بإطار قراءة (إطار القراءة) مع جين التقرير/العلامة القابلة للاختيار. حيث يتم إنهاء النسخ بشكل مبكر عند موقع البولي آدينيليشن المُدرَج. يُرمَز النسخ الدمجية المعالَجة إلى ترميز نسخة مقطوعة وغير وظيفية من البروتين الخلوي /العلامة القابلة للاختيار. وبالتالي، تُعطِل المصائد الجينية الجين المُصَيد في الإعلان عن تعبير حمض نووي ريبوزي منقوص الأكسجين في موقع الإدراج وتوفر وسمًا جينيًا للتعرف السريع على الجين المعطل (علامة تتبع متتالية المصيدة الجينية، GTST).^[1]^[2]

وصول

يقوم الاتحاد الدولي لمصائد الجينات بمركزية البيانات وتزويد خطوط الخلايا المعدلة على مستوى عالمي.^[3]

مراجع

^ Cobellis، G؛ Nicolaus، G؛ وآخرون (2005). "Tagging genes with cassette-exchange sites". Nucleic Acids Res. ج. 33 ع. 4: e44. DOI:10.1093/nar/gni045. PMC:552971. PMID:15741177.
^ De-Zolt، S؛ Schnutgen، F؛ وآخرون (2006). "High-throughput trapping of secretory pathway genes in mouse embryonic stem cells". Nucleic Acids Res. ج. 34 ع. 3: 25. DOI:10.1093/nar/gnj026. PMC:1369290. PMID:16478711.
^ "IGTC, International Gene Trap Consortium". www.genetrap.org. مؤرشف من الأصل في 2023-04-14. اطلع عليه بتاريخ 2018-02-11.

قراءات إضافية

Gossler A، Joyner AL، Rossant J، Skarnes WC (أبريل 1989). "Mouse embryonic stem cells and reporter constructs to detect developmentally regulated genes". Science. ج. 244 ع. 4903: 463–5. DOI:10.1126/science.2497519. PMID:2497519.
von Melchner H، Ruley HE (أغسطس 1989). "Identification of cellular promoters by using a retrovirus promoter trap". Journal of Virology. ج. 63 ع. 8: 3227–33. DOI:10.1128/JVI.63.8.3227-3233.1989. PMC:250892. PMID:2545900.
Friedrich G، Soriano P (سبتمبر 1991). "Promoter traps in embryonic stem cells: a genetic screen to identify and mutate developmental genes in mice". Genes & Development. ج. 5 ع. 9: 1513–23. DOI:10.1101/gad.5.9.1513. PMID:1653172.
Zambrowicz BP، Friedrich GA، Buxton EC، Lilleberg SL، Person C، Sands AT (أبريل 1998). "Disruption and sequence identification of 2,000 genes in mouse embryonic stem cells". Nature. ج. 392 ع. 6676: 608–11. DOI:10.1038/33423. PMID:9560157. S2CID:4329895.
Wiles MV، Vauti F، Otte J، Füchtbauer EM، Ruiz P، Füchtbauer A، Arnold HH، Lehrach H، Metz T، von Melchner H، Wurst W (يناير 2000). "Establishment of a gene-trap sequence tag library to generate mutant mice from embryonic stem cells". Nature Genetics. ج. 24 ع. 1: 13–4. DOI:10.1038/71622. PMID:10615117. S2CID:29505338.
Stanford WL، Cohn JB، Cordes SP (أكتوبر 2001). "Gene-trap mutagenesis: past, present and beyond". Nature Reviews Genetics. ج. 2 ع. 10: 756–68. DOI:10.1038/35093548. PMID:11584292. S2CID:11468334.
Skarnes WC، von Melchner H، Wurst W، Hicks G، Nord AS، Cox T، Young SG، Ruiz P، Soriano P، Tessier-Lavigne M، Conklin BR، Stanford WL، Rossant J (يونيو 2004). "A public gene trap resource for mouse functional genomics". Nature Genetics. ج. 36 ع. 6: 543–4. DOI:10.1038/ng0604-543. PMC:2716026. PMID:15167922.
Hansen J، Floss T، Van Sloun P، Füchtbauer EM، Vauti F، Arnold HH، Schnütgen F، Wurst W، von Melchner H، Ruiz P (أغسطس 2003). "A large-scale, gene-driven mutagenesis approach for the functional analysis of the mouse genome". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. ج. 100 ع. 17: 9918–22. DOI:10.1073/pnas.1633296100. PMC:187885. PMID:12904583.
Zambrowicz BP، Abuin A، Ramirez-Solis R، Richter LJ، Piggott J، BeltrandelRio H، وآخرون (نوفمبر 2003). "Wnk1 kinase deficiency lowers blood pressure in mice: a gene-trap screen to identify potential targets for therapeutic intervention". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. ج. 100 ع. 24: 14109–14. DOI:10.1073/pnas.2336103100. PMC:283554. PMID:14610273.
Schnütgen F، De-Zolt S، Van Sloun P، Hollatz M، Floss T، Hansen J، Altschmied J، Seisenberger C، Ghyselinck NB، Ruiz P، Chambon P، Wurst W، von Melchner H (مايو 2005). "Genomewide production of multipurpose alleles for the functional analysis of the mouse genome". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. ج. 102 ع. 20: 7221–6. DOI:10.1073/pnas.0502273102. PMC:1129123. PMID:15870191.
Springer PS (يوليو 2000). "Gene traps: tools for plant development and genomics". The Plant Cell. ج. 12 ع. 7: 1007–20. DOI:10.2307/3871251. JSTOR:3871251. PMC:149045. PMID:10899970.

بوابة علم الوراثة

مصيدة جينية في المشاريع الشقيقة:

[1] Cobellis، G؛ Nicolaus، G؛ وآخرون (2005). "Tagging genes with cassette-exchange sites". Nucleic Acids Res. ج. 33 ع. 4: e44. DOI:10.1093/nar/gni045. PMC:552971. PMID:15741177.

[2] De-Zolt، S؛ Schnutgen، F؛ وآخرون (2006). "High-throughput trapping of secretory pathway genes in mouse embryonic stem cells". Nucleic Acids Res. ج. 34 ع. 3: 25. DOI:10.1093/nar/gnj026. PMC:1369290. PMID:16478711.

[3] "IGTC, International Gene Trap Consortium". www.genetrap.org. مؤرشف من الأصل في 2023-04-14. اطلع عليه بتاريخ 2018-02-11.

[1]

[2]

[3]