تنبؤ بتآثر بروتين-بروتين

التنبؤ بتآثر بروتين-بروتين (بالإنجليزية: Protein–protein interaction prediction)‏ هو مجال يجمع بين المعلوماتية الحيوية وعلم الأحياء البنيوي في محاولةٍ لتحديد وفهرسة التآثرات الفيزيائية بين أزواج أو مجموعات البروتينات. فهم تآثرات البروتين-بروتين مهم في سبيل تقصي مسارات التأشير داخل الخلوية، نمذجة وتحديد بنُى المركبات البروتينية وللحصول على رؤىً وأفكارٍ حول مختلف العمليات البيوكيميائية.

برفلة تطور السلالات [English]: بروفايلات فيلوجينية لأربع جينات (C ،B ،A وD) مبينة يمينا. الرقم 1 يرمز لتواجد الجين في الجينوم و0 إلى غيابه. البروفايلان المتماثلان A وB موضحان بالأصفر.[1]

تجريبيا، يمكن استنتاج التآثرات الفيزيائية بين أزواج البروتينات من خلال العديد من التقنيات منها: أنظمة الهجينين الخميري، مقايسة تتام القطعة البروتينية [English] (PCA)، التنقية حسب الألفة/ مطيافية الكتلة، مصفوفات البروتين الدقيقة، انتقال طاقة رنين فورستر [English] (FRET) والرحلان الحراري ميكروي النطاق [English] (MST). هنالك مجهودات جارية لتحديد التآثروم الخاص بالعديد من الأجناس. عادة ما توفر التآثرات المحدَّدَة تجريبيا الأساس للتقنيات الحاسوبية للتنبؤ بالتآثرات المماثلة والشبيهة، على سبيل المثال: استخدام تسلسل بروتيني متماثل بين عدة أجناس. مع ذلك توجد طرق تتنبؤ بتآثرات جديدة من دون وجود معلومات سابقة حول تآثرات مماثلة.

مراجع

  1. ^ Raman، Karthik (15 فبراير 2010). "Construction and analysis of protein–protein interaction networks". Automated Experimentation. ج. 2 ع. 1: 2. DOI:10.1186/1759-4499-2-2. ISSN:1759-4499. PMC:2834675. PMID:20334628.