|
تضامنًا مع حق الشعب الفلسطيني |
مصمم الجينات
 | هذه مقالة غير مراجعة. (نوفمبر 2018) |
مصمم الجينات |
مصمم الجينات (بالإنجليزية: Gene designer) هي مجموعة برامج كمبيوتر للمعلوماتية الحيوية[1][2] ، يتم استخدامه من قبل علماء الأحياء الجزيئية من الأوساط الأكاديمية والحكومية والصناعات الدوائية والكيميائية والزراعية والتقنية الحيوية؛ لتصميم[3] واستنساخ والتحقق من التسلسل الجيني. إنها برمجيات ملك، تم إصدارها على أنها مجانية تحتاج إلى تسجيل.
الميزات
مصمم الجينات مكن علماء البيولوجيا الجزيئية من إدارة عملية تصميم الجينات في تطبيق واحد، وذلك باستخدام مجموعة من أدوات التصميم.
- خوارزميات في استنساخ السيليكو، تحسين الكودون، الترجمة، تصميم البرايمر
- عرض جزيئي مصور لعرض البنيات وتعليقها وتحريرها
- قابل لتخصيص قاعدة بيانات لتخزين، إدارة، مسار عناصر الجينات الوراثية والبنيات
- سحب وافلات واجهة لنقل عناصر التسلسل داخل أو بين البنيات (براءة اختراع)
- تحسين كودون لانتاج بروتينات مهجنة في أي كائن حي باستخدام خوارزميات متعددة
- إعادة ترميز قالب قراءة مفتوح
- تصميم قليل النيوكليوتيدات لتسلسل البرايمر تشمل حاسبة نقطة الانصهار
استخدام المعلم والطالب
وقد أدرجت هذه البرمجيات المجانية في المناهج الدراسية والفصول الدراسية لعلم البيولوجية التركبية، والانظمة البيولوجية، والهندسة الحيوية، والمعلوماتية الحيوية. يقوم الطلاب بإنشاء واستكمال المشاريع التي تدير عملية تصميم الجينات الكاملة في تطبيق واحد، باستخدام مجموعة من أدوات التصميم.
أمثلة على الاستخدام في المناهج الدراسية
- Synthetic Biophotonics Course; Utah State University, College of Engineering
- Lab Project using Gene Designer 2.0
- Systems Biology Lesson Overview
- Synthetic Biology Lesson Overview
- Student Projects
انظر أيضا
مراجع
- ^ Villalobos، Alan؛ Welch، Mark؛ Minshull، Jeremy (2012). "In Silico Design of Functional DNA Constructs". في Peccoud، Jean (المحرر). Gene Synthesis: Methods and Protocols. Methods in Molecular Biology. ج. 852. ص. 197–213. DOI:10.1007/978-1-61779-564-0_15. ISBN:978-1-61779-563-3. PMID:22328435.
- ^ Villalobos، Alan؛ Ness، Jon E؛ Gustafsson، Claes؛ Minshull، Jeremy؛ Govindarajan، Sridhar (2006). "Gene Designer: A synthetic biology tool for constructing artificial DNA segments". BMC Bioinformatics. ج. 7: 285. DOI:10.1186/1471-2105-7-285. PMC:1523223. PMID:16756672.
- ^ Welch، M؛ Villalobos، A؛ Gustafsson، C؛ Minshull، J (2011). "Designing genes for successful protein expression". في Voigt، Christopher (المحرر). Synthetic Biology, Part B: Computer Aided Design and DNA Assembly. Methods in Enzymology. ج. 498. ص. 43–66. DOI:10.1016/B978-0-12-385120-8.00003-6. ISBN:9780123851208. PMID:21601673.
روابط خارجية
http://www.dna20.com/resources/genedesigner
https://www.youtube.com/watch?v=lYk0ip4edZc
https://tele.engr.usu.edu/biophotonics_2010/Gene%20Designer/Gene%20Designer.html
