هذه المقالة يتيمة. ساعد بإضافة وصلة إليها في مقالة متعلقة بها
يفتقر محتوى هذه المقالة إلى مصادر موثوقة.
يرجى إضافة قالب معلومات متعلّقة بموضوع المقالة.

معلوماتية حيوية هيكلية

من أرابيكا، الموسوعة الحرة

هذه هي النسخة الحالية من هذه الصفحة، وقام بتعديلها عبود السكاف (نقاش | مساهمات) في 00:03، 4 فبراير 2023 (روبوت - إضافة لشريط البوابات :بوابة:علم الأحياء الخلوي والجزيئي + بوابة:علم الحاسوب). العنوان الحالي (URL) هو وصلة دائمة لهذه النسخة.

(فرق) → نسخة أقدم | نسخة حالية (فرق) | نسخة أحدث ← (فرق)
اذهب إلى التنقل اذهب إلى البحث

المعلوماتية الحيوية الهيكلية (التركيبية) هي فرع المعلوماتية الحيوية الذي يعنى بتحليل وتوقع التركيب ثلاثيّ الأبعاد للجزيئات الكبيرة الحيوية مثل: البروتينات، ال ار ان ايه وال دي ان ايه.

تتعامل مع تعميمات حول الشكل ثلاثي الأبعاد للجزيئات الكبيرة مثل مقارنة إجمالي الطيات والأنماط المحلية، مبادئ حدوث الطيات، التطور، تفاعلات تكوين الروابط، وعلاقات التركيب\الوظيفة، معتمدة على التراكيب التي تم الكشف عنها تجريبياً وعلى النماذج الحاسوبية.

مصطلح «هيكلية» له نفس دلالة المصطلح في «العلوم الحيوية الهيكلية (التركيبية)», ويمكن اعتبار المعلوماتية الحيوية الهيكلية كجزء من العلوم الحيوية الهيكلية المحوسبة.

أهميتها

تمر البروتينات بأربع مراحل بدئاً بتسلسل الأحماض الأمينية (المحددة من قبل الجينات) وانتهاءً بالشكل ثلاثي الأبعاد للبروتين. إن وظيفة البروتين تتحدد بشكل كبير من خلال شكله، لهذا فإن أي خطأ في التفاف وطي سلسلة الأحماض الأمينية سينتج عنه تغيير في الشكل النهائي وبالتالي لن يؤدي وظيفته كما هو مطلوب.

للأسف، هناك استنزاف كبير للوقت وتكلفة عالية لمعرفة أشكال البروتينات مخبرياً عن طريق تقنيات مثل دراسة البلورات بالأشعة السينية والرنين المغناطيسي النووي.

كنتيجة لهذا، أصبحت البروتينات معروفة التسلسل الحمضي الأميني أكثر بكثير من البروتينات معروفة الشكل، فكان الحل هو إيجاد طريقة آلية أو محوسبة تستطيع التنبؤ بشكل البروتين بسرعة عن طريق معرفة تسلسل الأحماض الأمينية.

التطبيقات الطبية الحيوية

تمت تجارب لتطبيق المعلوماتية الحيوية الهيكلية على بعض البروتينات الهامة لمعرفة أشكالها ثلاثية الأبعاد، مساعدة بذلك على اكتشاف آليات عملها ومحفزة لاكتشافات في الصناعات الدوائية.

المراجع

كتب

  • Bourne, P.E., and Gu, J. (2009) Structural Bioinformatics (2nd edition), John Wiley & Sons, New York, ISBN 978-0-470-18105-8
  • Bourne, P.E., and Weissig, H. (2003) Structural Bioinformatics, Wiley ISBN 0-471-20199-5
  • Leach, Andrew (2001) Molecular Modelling: Principles and Applications (2nd edition), Prentice Hall, ISBN 978-0-582-38210-7
  • Peitsch, M.C., and Schwede, T. (2008) Computational Structural Biology: Methods and Applications World Scientific, ISBN 978-9812778772

منشورات هولمارك

  • Leontis NB، Westhof E (2001). "Geometric nomenclature and classification of RNA base pairs". RNA. ج. 7 ع. 4: 499–512. DOI:10.1017/S1355838201002515. PMC:1370104. PMID:11345429.
  • Richardson JS (1981). "The anatomy and taxonomy of protein structure". Adv Protein Chem. Advances in Protein Chemistry. ج. 34: 167–339. DOI:10.1016/S0065-3233(08)60520-3. ISBN:978-0-12-034234-1. PMID:7020376. مؤرشف من الأصل في 2019-06-06.
  • Ramachandran GN، Sasisekharan V (1968). "Conformation of polypeptides and proteins". Adv Protein Chem. Advances in Protein Chemistry. ج. 23: 283–438. DOI:10.1016/S0065-3233(08)60402-7. ISBN:978-0-12-034223-5. PMID:4882249.
  • Ramachandran GN، Ramakrishnan C، Sasisekharan V (1963). "Stereochemistry of polypeptide chain configurations". J Mol Biol. ج. 7: 95–9. DOI:10.1016/S0022-2836(63)80023-6. PMID:13990617.


https://www.researchgate.net/profile/Kuo-Chen_Chou/publication/8429509_Structural_Bioinformatics_and_its_Impact_to_Biomedical_Science/links/0deec53cd0c4bc6cfe000000/Structural-Bioinformatics-and-its-Impact-to-Biomedical-Science.pdf

روابط خارجية

قواعد بيانات

برمجيات