يقام الدوري بمشاركة 28 فريقاً قسموا إلى أربعة مجموعات وكل مجموعة تضم سبعة فرق وسميت المجموعات حسب المناطق الجغرافية، وتلعبت الفرق دورى فيما بينها بطريقة الذهاب والإياب، يتأهل 3 فرق عن كل مجموعة للدور الثاني ليكون عدد الفرق في الدور الثاني 12 فريق ليلعبوا المرحلة النهائية للدورى التي أطلق عليها دوري النخبة حيث قسموا إلى اربع مجموعات يتاهل من كل مجموعة فريق إلى النصف نهائي
دور المجموعات
انطقلت يوم 28 أكتوبر2005 وتأهلت إلى دوري النخبة فرق الميناء وكربلاء وميسان من المجموعة الجنوبية والزوراء وسامراء والنجف من المجموعة الوسطى أ والشرطة والقوة الجوية والجيش من المجموعة الوسطى ب والطلبة ودهوك أربيل من المجموعة الشمالية
دوري النخبة
وانطلقت يوم 25 مارس2006 وتأهلت فرق أربيل والزوراء والنجف والقوة الجوية إلى دور النصف نهائي بعد تصدرها مجموعاتها
نصف النهائي
الذهاب
اقيمت مباريات النصف نهائي يوم 21 مايو 2006 بلقاء فريقي النجف واربيل على ملعب النجف والتي فاز بها النجف باربعة اهداف فيما التقى فريقي الزوراء والقوة الجوية في يوم 23 مايو 2006 على ملعب الشعب
التقى فريقي النجف واربيل يوم 26 مايو2006 على ملعب اربيل ولكن بسبب احداث الشغب تم تاجيل المباراة وفي نفس اليوم التقى فريقا الزوراء والقوة الجوية على ملعب الشعب الا ان المباراة شهدت أعمال شغب وحدثت معركة كبيرة بين الجماهير والقوات الامنية للملعب وانسحب على اثرها فريق القوة الجوية من النصف نهائي ولذلك تاهل فريق الزوراء
التقى فريقا النجف والزوراء في المباراة النهائية للدوري على ملعب السليمانية وانتهى الوقت الاصلي والإضافي بتعادل السلبي الا ان الزوراء تمكن من انهاءالمباراة بفوزه من خلال الضربات الترجيحية
حصلت قناة العراقية الرياضيةوشبكة الإعلام العراقي على حقوق النقل الحصرية للدوري وقامت بنقل كل المباريات سواءً مباشرة أو تسجيلها وعرضها في اوقات أخرى اما المباراة النهائية فقد تم بثها على جميع القنوات العراقية
