تضامنًا مع حق الشعب الفلسطيني |
فيروس ساربيكو
فيروس ساربيكو | |
---|---|
صورة بالتصوير المقطعي البردي الإلكتروني لسارس-كوف-2.
| |
تصنيف الفيروسات | |
المجموعة: | فيروس |
النطاق: | ريبوفيريا |
المملكة: | أرثوورنافيرات |
الشعبة: | بيسوفيريكوتا |
الطائفة: | بيسونيفريسيتس |
الرتبة: | فيروسات عشية |
الفصيلة: | فيروسات تاجية |
الأسرة: | فيروس كورونا |
الجنس: | فيروس كورونا بيتا |
الجنيس: | فيروس ساربيكو |
تعديل مصدري - تعديل |
فيروس ساربيكو (بالإنجليزية: Sarbecovirus) هو جنس فرعي من جنس فيروس كورونا بيتا يجمع فيروسات كورونا التي تسبب المتلازمة التنفسية الحادة الشديدة (السارس) والتي ينتمي إليها سارس-كوف-1 وسارس-كوف-2.[1][2]
الاسم الأجنبي ساربيكو منحوت من الحروف الأولى للكلمات: "SARS-like beta coronavirus" التي تعني فيروس كوروونا بيتا الشبيه بفيروس السارس. فيروسات الجنس الفرعي ساربيكو كانت تعرف سابقا باسم فيروسات كورونا المجموعة 2b.[3]
تستخدم فيروسات ساربيكو الإنزيم المحول للأنجيوتنسين (ACE2) كمستقبل، لكن لا يمكنها استخدام سوى مستقبلات ACE2 الخاصة ببعض الحيوانات فقط.[4] تصيب معظم فيروسات ساربيكو خفافيش حدوة الحصان لكن بعض السلالات تأقلمت مع ثدييات أخرى مثل: زباد النخل والغرير والإنسان كسارس-كوف، وآكل النمل الحرشفي سوندا والإنسان كسارس-كوف-2، وكذلك مختلف آكلات اللحوم (القطط، الببور، المنك الأمريكي والكلاب) التي ربما تعرضت للإصابة من البشر.[5]
تنظيم الجينوم
فضلا على المقارنات المبنية على تماثل تسلسل النوكليوتيدات داخل جنس فيروس كورونا بيتا، تتميز فيروسات الساربيكو بوجود العديد من إطارات القراءة المفتوحة بين جيني القفيصة النووية والغشاء.[3]
يتميز الجنس الفرعي فيروس ساربيكو بوجود بروتين واحد شبيه بالباباين (PLpro) في إطار القراءة المفتوح ORF1،[6] بدلا من اثنين كما هو الحال في الجنس الفرعي فيروس إمبيكو وجنس فيروس كورونا ألفا.[3]
الشجرة التطورية
|
الفيروسات المرتبطة بسارس-كوف
شجرة تطور السلالات الخاصة بسلالة سارس-كوف والسلالات القريبة لها بناء على دراسات سلسلة كامل الجينوم.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
سارس-كوف-2 79 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
فيروس خفاشي فيروس زباد النخل فيروس بشري
الفيروسات المرتبطة بسارس-كوف-2
شجرة تطور السلالات الخاصة بسلالة سارس-كوف-2 والسلالات القريبة لها[14][15] :
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
سارس-كوف 79% | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
فيروس خفاشي فيروس آكل النمل الحرشفي فيروس بشري
انظر أيضا
مراجع
- ^ "Phylogeny of SARS-like betacoronaviruses including novel coronavirus from Wuhan using data generated by the Shanghai Public Health Clinical Center & School of Public Health, the National Institute for Viral Disease Control and Prevention, the Institute of Pathogen Biology, and the Wuhan Institute of Virology shared via GISAID". https://nextstrain.org/. 16 يناير 2020. مؤرشف من الأصل في 2023-03-15. اطلع عليه بتاريخ 2020-01-25.
{{استشهاد ويب}}
: روابط خارجية في
(مساعدة).|موقع=
- ^ Antonio C. P. Wong, Xin Li, Susanna K. P. Lau et Patrick C. Y. Woo, « Global Epidemiology of Bat Coronaviruses », في Viruses, vol. 11, no 2, février 2019 [النص الكامل, lien PMID, lien DOI (pages consultées le 26 janvier 2020)] "نسخة مؤرشفة" (PDF). مؤرشف من الأصل في 2022-03-20. اطلع عليه بتاريخ 2022-05-22.
{{استشهاد ويب}}
: صيانة الاستشهاد: BOT: original URL status unknown (link) - ^ أ ب ت (بالإنجليزية) Patrick C. Y. Woo, Ming Wang, Susanna K. P. Lau et Huifang Xu, « Comparative Analysis of Twelve Genomes of Three Novel Group 2c and Group 2d Coronaviruses Reveals Unique Group and Subgroup Features », في Journal of Virology, vol. 81, no 4, 2007-02-15, ص. 1574–1585 ISSN 0022-538X [النص الكامل, lien PMID, lien PMCID, lien DOI (pages consultées le 2021-03-31)].
- ^ دُوِي:10.1111/tbed.13792
- ^ (بالإنجليزية) Z. ZhouCatégorie:Utilisation du paramètre auteur dans le modèle article, « The taxonomy, host range and pathogenicity of coronaviruses and other viruses in the Nidovirales order », في Animal Diseases, vol. 1, no 5, 2021 [النص الكامل, lien DOI].
- ^ Boni، Maciej F.؛ Lemey، Philippe؛ Jiang، Xiaowei؛ Lam، Tommy Tsan-Yuk؛ Perry، Blair W.؛ Castoe، Todd A.؛ Rambaut، Andrew؛ Robertson، David L. (28 يوليو 2020). "Evolutionary origins of the SARS-CoV-2 sarbecovirus lineage responsible for the COVID-19 pandemic". Nature Microbiology. Springer Science and Business Media LLC. ج. 5 ع. 11: 1408–1417. DOI:10.1038/s41564-020-0771-4. ISSN:2058-5276.
- ^ Kim Y, Son K, Kim YS, Lee SY, Jheong W, Oem JK (2019). "Complete genome analysis of a SARS-like bat coronavirus identified in the Republic of Korea". Virus Genes. ج. 55 ع. 4: 545–549. DOI:10.1007/s11262-019-01668-w. PMC:7089380. PMID:31076983.
{{استشهاد بدورية محكمة}}
: صيانة الاستشهاد: أسماء متعددة: قائمة المؤلفين (link) - ^ أ ب Li، W. (2005). "Bats Are Natural Reservoirs of SARS-Like Coronaviruses". Science. ج. 310 ع. 5748: 676–679. DOI:10.1126/science.1118391. ISSN:0036-8075.
- ^ أ ب Xing‐Yi Ge, Ben Hu, and Zheng‐Li Shi (2015). "BAT CORONAVIRUSES". في Lin-Fa Wang and Christopher Cowled (المحرر). Bats and Viruses: A New Frontier of Emerging Infectious Diseases, First Edition. John Wiley & Sons.
{{استشهاد بكتاب}}
: صيانة الاستشهاد: أسماء متعددة: قائمة المؤلفين (link) - ^ He B, Zhang Y, Xu L, Yang W, Yang F, Feng Y؛ وآخرون (2014). "Identification of diverse alphacoronaviruses and genomic characterization of a novel severe acute respiratory syndrome-like coronavirus from bats in China". J Virol. ج. 88 ع. 12: 7070–82. DOI:10.1128/JVI.00631-14. PMC:4054348. PMID:24719429.
{{استشهاد بدورية محكمة}}
: صيانة الاستشهاد: أسماء متعددة: قائمة المؤلفين (link) - ^ أ ب Lau، Susanna K. P.؛ Feng، Yun؛ Chen، Honglin؛ Luk، Hayes K. H.؛ Yang، Wei-Hong؛ Li، Kenneth S. M.؛ Zhang، Yu-Zhen؛ Huang، Yi؛ وآخرون (2015). "Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS) Coronavirus ORF8 Protein Is Acquired from SARS-Related Coronavirus from Greater Horseshoe Bats through Recombination". Journal of Virology. ج. 89 ع. 20: 10532–10547. DOI:10.1128/JVI.01048-15. ISSN:0022-538X.
- ^ أ ب Xing-Yi Ge؛ Jia-Lu Li؛ Xing-Lou Yang؛ وآخرون (2013). "Isolation and characterization of a bat SARS-like coronavirus that uses the ACE2 receptor". Nature. ج. 503 ع. 7477: 535–8. Bibcode:2013Natur.503..535G. DOI:10.1038/nature12711. PMC:5389864. PMID:24172901.
- ^ Yang XL, Hu B, Wang B, Wang MN, Zhang Q, Zhang W؛ وآخرون (2016). "Isolation and Characterization of a Novel Bat Coronavirus Closely Related to the Direct Progenitor of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus". J Virol. ج. 90 ع. 6: 3253–6. DOI:10.1128/JVI.02582-15. PMC:4810638. PMID:26719272.
{{استشهاد بدورية محكمة}}
: صيانة الاستشهاد: أسماء متعددة: قائمة المؤلفين (link) - ^ أ ب Wacharapluesadee S، Tan CW، Maneeorn P، Duengkae P، Zhu F، Joyjinda Y، وآخرون (فبراير 2021). "Evidence for SARS-CoV-2 related coronaviruses circulating in bats and pangolins in Southeast Asia". Nature Communications. ج. 12 ع. 1: 972. DOI:10.1038/s41467-021-21240-1. PMC:7873279. PMID:33563978.
- ^ أ ب ت Hul V, Delaune D, Karlsson EA, Hassanin A, Tey PO, Baidaliuk A, et al. (26 Jan 2021). "A novel SARS-CoV-2 related coronavirus in bats from Cambodia". bioRxiv (بEnglish). pp. 2021.01.26.428212. DOI:10.1101/2021.01.26.428212.
- ^ Murakami، Shin؛ Kitamura، Tomoya؛ Suzuki، Jin؛ Sato، Ryouta؛ Aoi، Toshiki؛ Fujii، Marina؛ Matsugo، Hiromichi؛ Kamiki، Haruhiko؛ Ishida، Hiroho؛ Takenaka-Uema، Akiko؛ Shimojima، Masayuki؛ Horimoto، Taisuke (2020). "Detection and Characterization of Bat Sarbecovirus Phylogenetically Related to SARS-CoV-2, Japan". Emerging Infectious Diseases. ج. 26 ع. 12: 3025–3029. DOI:10.3201/eid2612.203386. ISSN:1080-6040.
- ^ أ ب Hu، Dan؛ Zhu، Changqiang؛ Ai، Lele؛ He، Ting؛ Wang، Yi؛ Ye، Fuqiang؛ Yang، Lu؛ Ding، Chenxi؛ Zhu، Xuhui؛ Lv، Ruicheng؛ Zhu، Jin؛ Hassan، Bachar؛ Feng، Youjun؛ Tan، Weilong؛ Wang، Changjun (2018). "Genomic characterization and infectivity of a novel SARS-like coronavirus in Chinese bats". Emerging Microbes & Infections. ج. 7 ع. 1: 1–10. DOI:10.1038/s41426-018-0155-5. ISSN:2222-1751.
- ^ Lam، Tommy Tsan-Yuk؛ وآخرون (2020). "Identifying SARS-CoV-2-related coronaviruses in Malayan pangolins". Nature. ج. 583 ع. 7815: 282–285. DOI:10.1038/s41586-020-2169-0. ISSN:0028-0836.
- ^ Xiao، Kangpeng؛ Zhai، Junqiong؛ Feng، Yaoyu؛ Zhou، Niu؛ Zhang، Xu؛ Zou، Jie-Jian؛ Li، Na؛ Guo، Yaqiong؛ Li، Xiaobing؛ Shen، Xuejuan؛ Zhang، Zhipeng؛ Shu، Fanfan؛ Huang، Wanyi؛ Li، Yu؛ Zhang، Ziding؛ Chen، Rui-Ai؛ Wu، Ya-Jiang؛ Peng، Shi-Ming؛ Huang، Mian؛ Xie، Wei-Jun؛ Cai، Qin-Hui؛ Hou، Fang-Hui؛ Chen، Wu؛ Xiao، Lihua؛ Shen، Yongyi (9 يوليو 2020). "Isolation of SARS-CoV-2-related coronavirus from Malayan pangolins". Nature. ج. 583 ع. 7815: 286–289. DOI:10.1038/s41586-020-2313-x.
- ^ Zhou، Hong؛ Chen، Xing؛ Hu، Tao؛ Li، Juan؛ Song، Hao؛ Liu، Yanran؛ Wang، Peihan؛ Liu، Di؛ Yang، Jing؛ Holmes، Edward C.؛ Hughes، Alice C.؛ Bi، Yuhai؛ Shi، Weifeng (2020). "A Novel Bat Coronavirus Closely Related to SARS-CoV-2 Contains Natural Insertions at the S1/S2 Cleavage Site of the Spike Protein". Current Biology. ج. 30 ع. 11: 2196–2203.e3. DOI:10.1016/j.cub.2020.05.023. ISSN:0960-9822.
- ^ Zhou، Peng؛ Yang، Xing-Lou؛ Wang، Xian-Guang؛ Hu، Ben؛ Zhang، Lei؛ Zhang، Wei؛ Si، Hao-Rui؛ Zhu، Yan؛ Li، Bei؛ Huang، Chao-Lin؛ Chen، Hui-Dong؛ Chen، Jing؛ Luo، Yun؛ Guo، Hua؛ Jiang، Ren-Di؛ Liu، Mei-Qin؛ Chen، Ying؛ Shen، Xu-Rui؛ Wang، Xi؛ Zheng، Xiao-Shuang؛ Zhao، Kai؛ Chen، Quan-Jiao؛ Deng، Fei؛ Liu، Lin-Lin؛ Yan، Bing؛ Zhan، Fa-Xian؛ Wang، Yan-Yi؛ Xiao، Geng-Fu؛ Shi، Zheng-Li (2020). "A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin". Nature. ج. 579 ع. 7798: 270–273. DOI:10.1038/s41586-020-2012-7. ISSN:0028-0836.
{{استشهاد بدورية محكمة}}
: الوسيط غير المعروف|displayauthors=
تم تجاهله يقترح استخدام|إظهار المؤلفين=
(مساعدة) - ^ Temmam، Sarah؛ Vongphayloth، Khamsing؛ Baquero، Eduard؛ Munier، Sandie؛ Bonomi، Massimiliano؛ Regnault، Béatrice؛ Douangboubpha، Bounsavane؛ Karami، Yasaman؛ Chrétien، Delphine؛ Sanamxay، Daosavanh؛ Xayaphet، Vilakhan؛ Paphaphanh، Phetphoumin؛ Lacoste، Vincent؛ Somlor، Somphavanh؛ Lakeomany، Khaithong؛ Phommavanh، Nothasin؛ Pérot، Philippe؛ Dehan، Océane؛ Amara، Faustine؛ Donati، Flora؛ Bigot، Thomas؛ Nilges، Michael؛ Rey، Félix A.؛ van der Werf، Sylvie؛ Brey، Paul T.؛ Eloit، Marc (16 فبراير 2022). "Bat coronaviruses related to SARS-CoV-2 and infectious for human cells". Nature. DOI:10.1038/s41586-022-04532-4.