|
تضامنًا مع حق الشعب الفلسطيني |
منطقة بين الجينيات
منطقة بين الجينيات (بالإنجليزية: Intergenic region) هي امتداد لتسلسلات من الدنا تقع بين الجينات.[1] المناطق بين الجينية هي جزء من الدنا غير المشفر. في بعض الأحيان يعمل الدنا بين الجيني على تنظيم الجينات المجاورة له، لكن معظمه لا يملك وظيفة معروفة حاليا، وهي إحدى تسلسلات الدنا التي يُشار إليها أحيانا بالدنا الخردة لكن هذا المصطلح قل استخدامه في الدراسات العلمية اليوم. مؤخرا عُرف الرنا المنسوخ من أجزاء من هذه التسلسلات بين الجينات «بالمادة المظلمة» أو «نُسخ المادة المظلمة».[2]
الخصائص
المناطق بين الجينات مختلفة عن المناطق البينية داخل الجينية (intragenic regions) التي تُعرف بالإنترونات وهي مناطق قصيرة غير مشفرة موجودة داخل الجينات، وخاصة داخل جينات حقيقيات النوى.
تبعا لمشروع موسوعة عناصر الحمض النووى (ENCODE) ودراسته للجينوم البشري، بسبب تمدد المناطق الجينية عبر اكتشاف نظائر جديدة وتحديد نسخ رنا بين جينية جديدة، فإنه توجد زيادة في عدد المناطق بين الجينية (من 32481 إلى 60250) بسبب تجزُئها، ويوجد انخفاض في متوسط طولها (من 14170 زوج قاعدي إلى 3949 زوج قاعدي).[3]
تمكن العلماء الآن من تخليق بروتيناتٍ اصطناعيا من المناطق بين الجينية.[4]
الوظيفة
تاريخيا سُميت المناطق بين الجينية بالدنا الخردة مما يوحي بأنها لا تملك وظيفة. مع ذلك، معروفٌ منذ مدة طويلة أن تلك المناطق تحتوي على عناصر مهمة وظيفيا مثل المحفزات والمحسنات. عادة ما تحتوي المناطق بين الجينية على تسلسلات دنا محسنة والتي تُنشط التعبير عن مجموعات منفصلة من الجينات تبعد عنها بعدة آلاف من الأزواج القاعدية. التغيرات في البروتينات التي ترتبط بالمحسنات تعيد برمجة التعبير الجيني وتؤثر على النمط الظاهري للخلية.[5][6] يمكن أن تحتوي المناطق بين الجينية كذلك على جينات غير محددة بعد مثل جينات للرنا غير المشفر. رغم أنه لا يُعرف الكثير عن هذه المناطق إلا أنه يُعتقد بأن لها وظائف تنظيمية. في الأعوام الأخيرة يقوم مشروع ENCODE بدراسة المناطق بين الجينية في البشر بشكل أكثر تفصيلا.[7][8] طُورت طرق إحصائية خصيصا للكشف عن السمات أو الأمراض المرتبطة بالمناطق بين الجينية باستخدام بيانات سَلسَلة كامل الجينوم بما في ذلك إجراء النافذة المنزلقة[9] وإجراءالنافذة الديناميكي.[10][11]
مناطق بين جينية في الكائنات
تشكل المناطق بين الجينية لدى البشر حوالي 50% من الجينوم، في حين أن ذلك الرقم أقل بكثير لدى البكتيريا (15%) ولدى الخميرة (30%).[12]
في المتصورة المنجلية تحتوي العديد من المناطق بين الجينية على محتوى AT (أدينين، ثايمين) يشكل 90% منها.[13]
مراجع
- ^ Tropp BE (2008). Molecular Biology: Genes to Proteins. Jones & Bartlett Learning. ISBN:9780763709167.
- ^ van Bakel H، Nislow C، Blencowe BJ، Hughes TR (مايو 2010). "Most "dark matter" transcripts are associated with known genes". PLOS Biology. ج. 8 ع. 5: e1000371. DOI:10.1371/journal.pbio.1000371. PMC:2872640. PMID:20502517.
- ^ Djebali S، Davis CA، Merkel A، Dobin A، Lassmann T، Mortazavi A، وآخرون (سبتمبر 2012). "Landscape of transcription in human cells". Nature. ج. 489 ع. 7414: 101–8. Bibcode:2012Natur.489..101D. DOI:10.1038/nature11233. PMC:3684276. PMID:22955620. مؤرشف من الأصل في 2020-11-27.
- ^ Dhar PK، Thwin CS، Tun K، Tsumoto Y، Maurer-Stroh S، Eisenhaber F، Surana U (فبراير 2009). "Synthesizing non-natural parts from natural genomic template". Journal of Biological Engineering. ج. 3: 2. DOI:10.1186/1754-1611-3-2. PMC:2642765. PMID:19187561.
- ^ Schmidt SF، Larsen BD، Loft A، Nielsen R، Madsen JG، Mandrup S (سبتمبر 2015). "Acute TNF-induced repression of cell identity genes is mediated by NFκB-directed redistribution of cofactors from super-enhancers". Genome Research. ج. 25 ع. 9: 1281–94. DOI:10.1101/gr.188300.114. PMC:4561488. PMID:26113076.
- ^ Vlahopoulos SA (أغسطس 2017). "Aberrant control of NF-κB in cancer permits transcriptional and phenotypic plasticity, to curtail dependence on host tissue: molecular mode". Cancer Biology & Medicine. ج. 14 ع. 3: 254–270. DOI:10.20892/j.issn.2095-3941.2017.0029. PMC:5570602. PMID:28884042.
- ^ Birney E، Stamatoyannopoulos JA، Dutta A، Guigó R، Gingeras TR، Margulies EH، وآخرون (يونيو 2007). "Identification and analysis of functional elements in 1% of the human genome by the ENCODE pilot project". Nature. ج. 447 ع. 7146: 799–816. Bibcode:2007Natur.447..799B. DOI:10.1038/nature05874. PMC:2212820. PMID:17571346.
- ^ Dunham I (سبتمبر 2012). "An integrated encyclopedia of DNA elements in the human genome". Nature. ج. 489 ع. 7414: 57–74. Bibcode:2012Natur.489...57T. DOI:10.1038/nature11247. PMC:3439153. PMID:22955616.
- ^ Morrison AC، Huang Z، Yu B، Metcalf G، Liu X، Ballantyne C، وآخرون (فبراير 2017). "Practical Approaches for Whole-Genome Sequence Analysis of Heart- and Blood-Related Traits". American Journal of Human Genetics. ج. 100 ع. 2: 205–215. DOI:10.1016/j.ajhg.2016.12.009. PMC:5294677. PMID:28089252.
- ^ Li Z، Li X، Liu Y، Shen J، Chen H، Zhou H، وآخرون (مايو 2019). "Dynamic Scan Procedure for Detecting Rare-Variant Association Regions in Whole-Genome Sequencing Studies". American Journal of Human Genetics. ج. 104 ع. 5: 802–814. DOI:10.1016/j.ajhg.2019.03.002. PMC:6507043. PMID:30982610.
- ^ Li, Zilin; Liu, Yaowu; Lin, Xihong (14 Sep 2020). "Simultaneous Detection of Signal Regions Using Quadratic Scan Statistics With Applications to Whole Genome Association Studies". Journal of the American Statistical Association (بEnglish): 1–30. arXiv:1710.05021. DOI:10.1080/01621459.2020.1822849. ISSN:0162-1459. Archived from the original on 2020-12-29.
- ^ Francis WR، Wörheide G (يونيو 2017). "Similar Ratios of Introns to Intergenic Sequence across Animal Genomes". Genome Biology and Evolution. ج. 9 ع. 6: 1582–1598. DOI:10.1093/gbe/evx103. PMC:5534336. PMID:28633296.
- ^ Gardner MJ، Hall N، Fung E، White O، Berriman M، Hyman RW، وآخرون (أكتوبر 2002). "Genome sequence of the human malaria parasite Plasmodium falciparum". Nature. ج. 419 ع. 6906: 498–511. Bibcode:2002Natur.419..498G. DOI:10.1038/nature01097. PMC:3836256. PMID:12368864.
