عبد العزيز: بوت:صيانة المراجع

2023-01-29T01:20:22Z

بوت:صيانة المراجع

صفحة جديدة

{{Infobox protein family
| class = 
| Symbol = bCoV_Orf14
| Name = بروتين فيروس كورونا غير الموصوف 14
| image =
| caption =
| Pfam = PF17635
| Pfam_clan =
| InterPro = IPR035113
| SMART =
| PROSITE =
| MEROPS =
| CATH =
| SCOP =
| TCDB =
| OPM family =
| OPM protein =
| CAZy =
| CDD =
| Membranome superfamily =
| Membranome family =
}}
'''ORF9c''' (ويسمى كذلك ORF14) هو [[قالب قراءة مفتوح|إطار قراءة مفتوح]] ({{ام|ORF|open reading frame}}) في [[جنيس (تصنيف)|جُنيس]] [[فيروس كورونا المرتبط بالمتلازمة التنفسية الحادة الشديدة|فيروسات كورونا بيتا السارسية]] (Sarbecovirus).<ref name="redondo_2021">{{استشهاد بدورية محكمة |الأخير1=Redondo |الأول1=Natalia |الأخير2=Zaldívar-López |الأول2=Sara |الأخير3=Garrido |الأول3=Juan J. |الأخير4=Montoya |الأول4=Maria |عنوان=SARS-CoV-2 Accessory Proteins in Viral Pathogenesis: Knowns and Unknowns |صحيفة=Frontiers in Immunology |تاريخ=7 July 2021 |المجلد=12 |صفحات=708264 |pmid=34305949 | doi=10.3389/fimmu.2021.708264|pmc=8293742 }}</ref> طوله 73 [[شيفرة جينية|كودون]] في جينوم [[فيروس كورونا المرتبط بالمتلازمة التنفسية الحادة الشديدة النوع 2|سارس-كوف-2]].<ref name="jungreis_2021">{{استشهاد بدورية محكمة |الأخير1=Jungreis |الأول1=Irwin |الأخير2=Nelson |الأول2=Chase W. |الأخير3=Ardern |الأول3=Zachary |الأخير4=Finkel |الأول4=Yaara |الأخير5=Krogan |الأول5=Nevan J. |الأخير6=Sato |الأول6=Kei |الأخير7=Ziebuhr |الأول7=John |الأخير8=Stern-Ginossar |الأول8=Noam |الأخير9=Pavesi |الأول9=Angelo |الأخير10=Firth |الأول10=Andrew E. |الأخير11=Gorbalenya |الأول11=Alexander E. |الأخير12=Kellis |الأول12=Manolis |عنوان=Conflicting and ambiguous names of overlapping ORFs in the SARS-CoV-2 genome: A homology-based resolution |صحيفة=Virology |تاريخ=June 2021 |المجلد=558 |صفحات=145–151 |doi=10.1016/j.virol.2021.02.013|pmid=33774510 |pmc=7967279 }}</ref> رغم أنه مضمن في قائمة جينات [[بروتين فيروسي#بروتينات منظمة وملحقة فيروسية|البروتينات الملحقة]] الخاصة بالفيروسات السارسية، إلا أن دلائل من [[معلوماتية حيوية|المعلوماتية الحيوية]] تقترح بأن الـORF9c قد لا يكون جينا مشفرا لبروتين وظيفي.<ref name="jungreis_2021_natcom">{{استشهاد بدورية محكمة |الأخير1=Jungreis |الأول1=Irwin |الأخير2=Sealfon |الأول2=Rachel |الأخير3=Kellis |الأول3=Manolis |عنوان=SARS-CoV-2 gene content and COVID-19 mutation impact by comparing 44 Sarbecovirus genomes |صحيفة=Nature Communications |تاريخ=December 2021 |المجلد=12 |العدد=1 |صفحات=2642 |doi=10.1038/s41467-021-22905-7| pmc=8113528 }}</ref>

== التسمية ==
كان هنالك عدم توافق في التسمية المستخدمة لهذا الجين في المنشورات العلمية. أُشير إليه في بعض الأبحاث حول [[فيروس كورونا المرتبط بالمتلازمة التنفسية الحادة الشديدة النوع 1|سارس-كوف]] بالاسم ORF14.{{فاصل}}<ref name="marra_2003">{{استشهاد بدورية محكمة |الأخير1=Marra |الأول1=Marco A. |الأخير2=Jones |الأول2=Steven J. M. |الأخير3=Astell |الأول3=Caroline R. |الأخير4=Holt |الأول4=Robert A. |الأخير5=Brooks-Wilson |الأول5=Angela |الأخير6=Butterfield |الأول6=Yaron S. N. |الأخير7=Khattra |الأول7=Jaswinder |الأخير8=Asano |الأول8=Jennifer K. |الأخير9=Barber |الأول9=Sarah A. |الأخير10=Chan |الأول10=Susanna Y. |الأخير11=Cloutier |الأول11=Alison |الأخير12=Coughlin |الأول12=Shaun M. |الأخير13=Freeman |الأول13=Doug |الأخير14=Girn |الأول14=Noreen |الأخير15=Griffith |الأول15=Obi L. |الأخير16=Leach |الأول16=Stephen R. |الأخير17=Mayo |الأول17=Michael |الأخير18=McDonald |الأول18=Helen |الأخير19=Montgomery |الأول19=Stephen B. |last20=Pandoh |first20=Pawan K. |الأخير21=Petrescu |الأول21=Anca S. |الأخير22=Robertson |الأول22=A. Gordon |الأخير23=Schein |الأول23=Jacqueline E. |الأخير24=Siddiqui |الأول24=Asim |الأخير25=Smailus |الأول25=Duane E. |الأخير26=Stott |الأول26=Jeff M. |الأخير27=Yang |الأول27=George S. |الأخير28=Plummer |الأول28=Francis |الأخير29=Andonov |الأول29=Anton |الأخير30=Artsob |الأول30=Harvey |الأخير31=Bastien |الأول31=Nathalie |الأخير32=Bernard |الأول32=Kathy |الأخير33=Booth |الأول33=Timothy F. |الأخير34=Bowness |الأول34=Donnie |الأخير35=Czub |الأول35=Martin |الأخير36=Drebot |الأول36=Michael |الأخير37=Fernando |الأول37=Lisa |الأخير38=Flick |الأول38=Ramon |الأخير39=Garbutt |الأول39=Michael |الأخير40=Gray |الأول40=Michael |الأخير41=Grolla |الأول41=Allen |الأخير42=Jones |الأول42=Steven |الأخير43=Feldmann |الأول43=Heinz |الأخير44=Meyers |الأول44=Adrienne |الأخير45=Kabani |الأول45=Amin |الأخير46=Li |الأول46=Yan |الأخير47=Normand |الأول47=Susan |الأخير48=Stroher |الأول48=Ute |الأخير49=Tipples |الأول49=Graham A. |الأخير50=Tyler |الأول50=Shaun |الأخير51=Vogrig |الأول51=Robert |الأخير52=Ward |الأول52=Diane |الأخير53=Watson |الأول53=Brynn |الأخير54=Brunham |الأول54=Robert C. |الأخير55=Krajden |الأول55=Mel |الأخير56=Petric |الأول56=Martin |الأخير57=Skowronski |الأول57=Danuta M. |الأخير58=Upton |الأول58=Chris |الأخير59=Roper |الأول59=Rachel L. |عنوان=The Genome Sequence of the SARS-Associated Coronavirus |صحيفة=Science |تاريخ=30 May 2003 |المجلد=300 |العدد=5624 |صفحات=1399–1404 |doi=10.1126/science.1085953}}</ref> وسمي في بعض الأحيان ORF9b، بينما جاره الطويل [[ORF9b]] المتواجد [[عكس الاتجاه ومع الاتجاه (دنا)|عكس الاتجاه]] سُمي ORF9a. التسمية الحالية الموصى بها هي أن يُشار إلى هذا الجين بـORF9c وللجين الموجود عكس الاتجاه بـORF9b.{{فاصل}}<ref name="jungreis_2021" />

== التعبير والتآثرات ==
ORF9c هو أحد [[جين متداخل|جينين متداخلين]] اثنين يتواجدان كليا داخل [[قالب قراءة مفتوح|إطار القراءة المفتوح]] الخاص بجين [[بروتين القفيصة النووية لفيروس كورونا|القفيصة النووية]] لفيروس كورونا، والآخر هو [[ORF9b]]. غير واضح ما إذا كان ORF9c [[ترجمة (وراثة)|يُترجم]] وظيفيا أثناء الإصابة بسارس-كوف-2، وقد أُبلغ أنه لا تتم ترجمته تحت الظروف التجريبية.<ref name="finkel_2021">{{استشهاد بدورية محكمة |الأخير1=Finkel |الأول1=Yaara |الأخير2=Mizrahi |الأول2=Orel |الأخير3=Nachshon |الأول3=Aharon |الأخير4=Weingarten-Gabbay |الأول4=Shira |الأخير5=Morgenstern |الأول5=David |الأخير6=Yahalom-Ronen |الأول6=Yfat |الأخير7=Tamir |الأول7=Hadas |الأخير8=Achdout |الأول8=Hagit |الأخير9=Stein |الأول9=Dana |الأخير10=Israeli |الأول10=Ofir |الأخير11=Beth-Din |الأول11=Adi |الأخير12=Melamed |الأول12=Sharon |الأخير13=Weiss |الأول13=Shay |الأخير14=Israely |الأول14=Tomer |الأخير15=Paran |الأول15=Nir |الأخير16=Schwartz |الأول16=Michal |الأخير17=Stern-Ginossar |الأول17=Noam |عنوان=The coding capacity of SARS-CoV-2 |صحيفة=Nature |تاريخ=7 January 2021 |المجلد=589 |العدد=7840 |صفحات=125–130 |doi=10.1038/s41586-020-2739-1}}</ref> حين يُعبر عنه تجريبيا، يتآثر البروتين مع {{وإو|لغ=en|تر=Sigma receptor|عر=مستقبل سيغما|نص=مستقبلات سيغما}} ومع مسار [[عامل نووي معزز لسلسلة كابا الخفيفة في الخلايا البائية النشطة]].<ref name=redondo_2021 /><ref name="gordon_2020">{{استشهاد بدورية محكمة |الأخير1=Gordon |الأول1=David E. |الأخير2=Jang |الأول2=Gwendolyn M. |الأخير3=Bouhaddou |الأول3=Mehdi |الأخير4=Xu |الأول4=Jiewei |الأخير5=Obernier |الأول5=Kirsten |الأخير6=White |الأول6=Kris M. |الأخير7=O’Meara |الأول7=Matthew J. |الأخير8=Rezelj |الأول8=Veronica V. |الأخير9=Guo |الأول9=Jeffrey Z. |الأخير10=Swaney |الأول10=Danielle L. |الأخير11=Tummino |الأول11=Tia A. |الأخير12=Hüttenhain |الأول12=Ruth |الأخير13=Kaake |الأول13=Robyn M. |الأخير14=Richards |الأول14=Alicia L. |الأخير15=Tutuncuoglu |الأول15=Beril |الأخير16=Foussard |الأول16=Helene |الأخير17=Batra |الأول17=Jyoti |الأخير18=Haas |الأول18=Kelsey |الأخير19=Modak |الأول19=Maya |last20=Kim |first20=Minkyu |الأخير21=Haas |الأول21=Paige |الأخير22=Polacco |الأول22=Benjamin J. |الأخير23=Braberg |الأول23=Hannes |الأخير24=Fabius |الأول24=Jacqueline M. |الأخير25=Eckhardt |الأول25=Manon |الأخير26=Soucheray |الأول26=Margaret |الأخير27=Bennett |الأول27=Melanie J. |الأخير28=Cakir |الأول28=Merve |الأخير29=McGregor |الأول29=Michael J. |الأخير30=Li |الأول30=Qiongyu |الأخير31=Meyer |الأول31=Bjoern |الأخير32=Roesch |الأول32=Ferdinand |الأخير33=Vallet |الأول33=Thomas |الأخير34=Mac Kain |الأول34=Alice |الأخير35=Miorin |الأول35=Lisa |الأخير36=Moreno |الأول36=Elena |الأخير37=Naing |الأول37=Zun Zar Chi |الأخير38=Zhou |الأول38=Yuan |الأخير39=Peng |الأول39=Shiming |الأخير40=Shi |الأول40=Ying |الأخير41=Zhang |الأول41=Ziyang |الأخير42=Shen |الأول42=Wenqi |الأخير43=Kirby |الأول43=Ilsa T. |الأخير44=Melnyk |الأول44=James E. |الأخير45=Chorba |الأول45=John S. |الأخير46=Lou |الأول46=Kevin |الأخير47=Dai |الأول47=Shizhong A. |الأخير48=Barrio-Hernandez |الأول48=Inigo |الأخير49=Memon |الأول49=Danish |الأخير50=Hernandez-Armenta |الأول50=Claudia |الأخير51=Lyu |الأول51=Jiankun |الأخير52=Mathy |الأول52=Christopher J. P. |الأخير53=Perica |الأول53=Tina |الأخير54=Pilla |الأول54=Kala Bharath |الأخير55=Ganesan |الأول55=Sai J. |الأخير56=Saltzberg |الأول56=Daniel J. |الأخير57=Rakesh |الأول57=Ramachandran |الأخير58=Liu |الأول58=Xi |الأخير59=Rosenthal |الأول59=Sara B. |الأخير60=Calviello |الأول60=Lorenzo |الأخير61=Venkataramanan |الأول61=Srivats |الأخير62=Liboy-Lugo |الأول62=Jose |الأخير63=Lin |الأول63=Yizhu |الأخير64=Huang |الأول64=Xi-Ping |الأخير65=Liu |الأول65=YongFeng |الأخير66=Wankowicz |الأول66=Stephanie A. |الأخير67=Bohn |الأول67=Markus |الأخير68=Safari |الأول68=Maliheh |الأخير69=Ugur |الأول69=Fatima S. |الأخير70=Koh |الأول70=Cassandra |الأخير71=Savar |الأول71=Nastaran Sadat |الأخير72=Tran |الأول72=Quang Dinh |الأخير73=Shengjuler |الأول73=Djoshkun |الأخير74=Fletcher |الأول74=Sabrina J. |الأخير75=O’Neal |الأول75=Michael C. |الأخير76=Cai |الأول76=Yiming |الأخير77=Chang |الأول77=Jason C. J. |الأخير78=Broadhurst |الأول78=David J. |الأخير79=Klippsten |الأول79=Saker |الأخير80=Sharp |الأول80=Phillip P. |الأخير81=Wenzell |الأول81=Nicole A. |الأخير82=Kuzuoglu-Ozturk |الأول82=Duygu |الأخير83=Wang |الأول83=Hao-Yuan |الأخير84=Trenker |الأول84=Raphael |الأخير85=Young |الأول85=Janet M. |الأخير86=Cavero |الأول86=Devin A. |الأخير87=Hiatt |الأول87=Joseph |الأخير88=Roth |الأول88=Theodore L. |الأخير89=Rathore |الأول89=Ujjwal |الأخير90=Subramanian |الأول90=Advait |الأخير91=Noack |الأول91=Julia |الأخير92=Hubert |الأول92=Mathieu |الأخير93=Stroud |الأول93=Robert M. |الأخير94=Frankel |الأول94=Alan D. |الأخير95=Rosenberg |الأول95=Oren S. |الأخير96=Verba |الأول96=Kliment A. |الأخير97=Agard |الأول97=David A. |الأخير98=Ott |الأول98=Melanie |الأخير99=Emerman |الأول99=Michael |الأخير100=Jura |الأول100=Natalia |الأخير101=von Zastrow |الأول101=Mark |الأخير102=Verdin |الأول102=Eric |الأخير103=Ashworth |الأول103=Alan |الأخير104=Schwartz |الأول104=Olivier |الأخير105=d’Enfert |الأول105=Christophe |الأخير106=Mukherjee |الأول106=Shaeri |الأخير107=Jacobson |الأول107=Matt |الأخير108=Malik |الأول108=Harmit S. |الأخير109=Fujimori |الأول109=Danica G. |الأخير110=Ideker |الأول110=Trey |الأخير111=Craik |الأول111=Charles S. |الأخير112=Floor |الأول112=Stephen N. |الأخير113=Fraser |الأول113=James S. |الأخير114=Gross |الأول114=John D. |الأخير115=Sali |الأول115=Andrej |الأخير116=Roth |الأول116=Bryan L. |الأخير117=Ruggero |الأول117=Davide |الأخير118=Taunton |الأول118=Jack |الأخير119=Kortemme |الأول119=Tanja |الأخير120=Beltrao |الأول120=Pedro |الأخير121=Vignuzzi |الأول121=Marco |الأخير122=García-Sastre |الأول122=Adolfo |الأخير123=Shokat |الأول123=Kevan M. |الأخير124=Shoichet |الأول124=Brian K. |الأخير125=Krogan |الأول125=Nevan J. |عنوان=A SARS-CoV-2 protein interaction map reveals targets for drug repurposing |صحيفة=Nature |تاريخ=16 July 2020 |المجلد=583 |العدد=7816 |صفحات=459–468 |doi=10.1038/s41586-020-2286-9|pmc=7431030 }}</ref> يقوم بروتين سارس-كوف بتآثرات ذاتية وهو ما يوحي بأنه يشكل [[مثنوي بروتين]] أو [[قليل القسيمات|قليل قسيمات]].<ref name="vonbrunn_2007">{{استشهاد بدورية محكمة |الأخير1=von Brunn |الأول1=Albrecht |الأخير2=Teepe |الأول2=Carola |الأخير3=Simpson |الأول3=Jeremy C. |الأخير4=Pepperkok |الأول4=Rainer |الأخير5=Friedel |الأول5=Caroline C. |الأخير6=Zimmer |الأول6=Ralf |الأخير7=Roberts |الأول7=Rhonda |الأخير8=Baric |الأول8=Ralph |الأخير9=Haas |الأول9=Jürgen |عنوان=Analysis of Intraviral Protein-Protein Interactions of the SARS Coronavirus ORFeome |صحيفة=PLoS ONE |تاريخ=23 May 2007 |المجلد=2 |العدد=5 |صفحات=e459 |pmid=17520018| doi=10.1371/journal.pone.0000459}}</ref>

== التطور ==
لدى ORF9c [[تراصف تسلسلي|تماثل تسلسل]] يقدر بـ74% بين سارس-كوف وسارس-كوف-2.<ref name=redondo_2021 />

تم تحديد [[متحورات فيروس كورونا المرتبط بالمتلازمة التنفسية الحادة الشديدة النوع 2|متحوراتٍ لسارس-كوف-2]] فيها [[كودون توقف|كودونات توقف]] مبتسرة وأخرى فقدت [[كودون بدء|كودون البداية]] الخاص بها، و[[بنية بروتين أولية|تسلسل الأحماض الأمينية]] غير [[تسلسل محفوظ|منحفظ]] جيدا بينها، وهو ما يدعم فرضية أن هذا الجين لا يشفر بروتينا وظيفيا.<ref name=jungreis_2021_natcom /><ref name=gordon_2020 />

== مراجع ==
{{مراجع|محاذاة=نعم}}
{{جينومات فيروس كورونا}}
{{شريط بوابات|علم الوراثة|كيمياء حيوية|علم الفيروسات}}

[[تصنيف:بروتينات فيروس كورونا]]
[[تصنيف:بروتينات فيروسية لابنيوية]]

ORF9c - تاريخ المراجعة

عبد العزيز: بوت:صيانة المراجع