https://3rabica.org/index.php?action=history&feed=atom&title=%D9%83%D9%84%D9%88%D8%B3%D8%AA%D8%A7%D9%84كلوستال - تاريخ المراجعة2026-06-09T00:53:24Zتاريخ التعديل لهذه الصفحة في الويكيMediaWiki 1.43.7https://3rabica.org/index.php?title=%D9%83%D9%84%D9%88%D8%B3%D8%AA%D8%A7%D9%84&diff=1441762&oldid=prevعبد العزيز: /* انظر أيضاً */ تعديل خطأ إملائي في التعريب2023-07-20T15:42:26Z<p><span class="autocomment">انظر أيضاً: </span> تعديل خطأ إملائي في التعريب</p>
<p><b>صفحة جديدة</b></p><div>{{تدقيق لغوي|date=يوليو 2018}}<br />
{{بطاقة برمجية<br />
|name=Clustal<br />
|developer=Gibson T. ([[مختبر علم الأحياء الجزيئي الأوروبي]]), Thompson J. ([[المركز الوطني الفرنسي للبحث العلمي]]), Higgins D. ([[كلية دبلن الجامعية]])<br />
|latest_release_version=2.1<br />
|latest release date= {{تاريخ إطلاق وعمر|2010|11|17|df=yes}}<br />
|operating_system=[[يونكس]], [[جنو/لينكس]], [[ماكنتوش]], [[مايكروسوفت ويندوز]]<br />
|programming language=C++<br />
|genre=Bioinformatics tool<br />
|licence=Free for academic users<br />
|website=[http://www.clustal.org Clustal]}}<br />
<br />
'''كلوستال''' {{إنج|Clustal}}، هو [[برنامج (حاسوب)|برنامج حاسوبي]] يستخدم بكثرة لمحاذاة التسلسلات المتعددة، وأحدث إصدار له هو 2.1،<ref name="Larkin2007">{{استشهاد بدورية محكمة|مؤلف=Larkin MA, Blackshields G, Brown NP, Chenna R, McGettigan PA, McWilliam H, Valentin F, Wallace IM, Wilm A, Lopez R, Thompson JD, Gibson TJ, Higgins DG |عنوان=ClustalW and ClustalX version 2 |صحيفة=Bioinformatics |المجلد=23 |العدد=21 |صفحات=2947–2948 |سنة=2007 |pmid=17846036 |doi=10.1093/bioinformatics/btm404}}</ref> وهناك اختلافان رئيسيان في هذا البرنامج فيما يتعلق بالواجهة:<br />
<br />
* '''كلوستال دبليو (ClustalW)''': الواجهة تعتمد على كتابة الأوامر.<br />
* '''كلوستال اكس (ClustalX)''': واجهة المستخدم لهذا الإصدار رسومية ([[واجهة مستخدم رسومية]])،<ref name="Thompson1997">{{استشهاد بدورية محكمة|doi=10.1093/nar/25.24.4876 |مؤلف=Thompson JD, Gibson TJ, Plewniak F, Jeanmougin F, Higgins DG |عنوان=The CLUSTAL_X windows interface: flexible strategies for multiple sequence alignment aided by quality analysis tools |صحيفة=Nucleic Acids Research |المجلد=25 |العدد=24 |صفحات=4876–4882 |سنة=1997 |pmid=9396791 |pmc=147148}}</ref> ويمكن استخدامه في أنظمة التشغيل المختلفة مثل ويندوز ([[مايكروسوفت ويندوز|Windows]]) وأبل ماك ([[آي أو إس|IOS]]) ويونيكس/لينكس ([[يونكس|Unix]]).<br />
<br />
هذا البرنامج متوفرعلى [http://www.clustal.org الصفحة الرئيسية لكلوستال] أو [ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/software/ ملقم FTP g لمعهد الأوربي لعلم تقنيات المعلومات الحيوي] .<br />
<br />
== معلومات ==<br />
يستخدم الموقع في التطبيقات الحاسوبية (bioinformatics), بحيث إذا كنت تمتلك العديد من السلاسل الجينية التي تحتوي على مواقع متداخلة في ما بينها يقوم بتحديد المناطق المتشابهة بين العديد من السلاسل الجينية. تم إنشاء هذا الموقع عام 1992 وتم تطوير هذا الموقع في عام 1994، وهو من أكثر المواقع المستخدمة في ترتيب العديد من السلاسل الجينية وذلك لأنه سريع ودقيق بما فيه الكفاية.<br />
<br />
== الإدخال والإخراج ==<br />
<br />
يقبل هذا البرنامج صيغ إدخال مختلفة تشمل NBRF/PIR وفاستا و EMBL/Swissport وكلوستال و GCC/MSF و GCG9 RSF و GDE.<br />
<br />
أما صيغ الإخراج فقد تشمل واحدة أو أكثر من الصيغ التالية: كلوستال أو NBRF/PIR أو GCG/MSF أو PHYLIP أو GDE أو NEXUS.<br />
<br />
== محاذاة التسلسل المتعدد ==<br />
هناك ثلاث خطوات رئيسية:<br />
# إنشاء محاذاة عشوائية.<br />
# إنشاء [[شجرة تطور السلالات|شجرة المَحْتِد]] أو ما تعرف بشجرة التطور (أو استخدام شجرة عرّفها المستخدم).<br />
# استخدام شجرة التطور لإكمال سلسلة المحاذاة.<br />
<br />
كل ما ذكر يتم تلقائياً بمجرد اختيارك «إنشاء محاذاة كاملة»، وهناك خيارات أخرى وهي «إنشاء محاذاة من شجرة الدليل» و «إنشاء شجرة دليل فقط».<br />
<br />
== الإعداد ==<br />
يستطيع المستخدمون محاذاة التسلسلات باستخدام الإعداد الافتراضي ولكن قد يكون من المفيد أحياناً تخصيص مدخلات المستخدم، والمدخلات الأساسية في توسيع المسافة وتمديدها.<br />
<br />
== انظر أيضاً ==<br />
* برمجيات محاذاة التسلسل<br />
* تي بن (T-Coffee)<br />
* محاذاة إم (Align-m)<br />
* ديالاين تي (DIALIGN-T)<br />
* ديالاين تي اكس (DIALIGN-TX)<br />
* جاليجنير (JAligner)<br />
* مافت (MAFFT)<br />
* مافيد (MAVID)<br />
* ماسل (MUSCLE)<br />
* بروبكونس (ProbCons)<br />
<br />
== المراجع ==<br />
{{مراجع}}<br />
<br />
== وصلات خارجية ==<br />
* [http://www.clustal.org {]/0الصفحة الرئيسية لكلوستال} (التحميل مجاني ليونيكس / لينكس، ماك، Windows)<br />
* [http://www.ebi.ac.uk/Tools/clustalw2/index.html ClustalW و ClustalX في بنك الإمارات الدولي] (التحميل مجانا ليونيكس / لينكس، ماك، Windows)<br />
* " [http://www.progeniq.com/news/BioBoost%20White%20Paper.pdf تسريع التطبيقات المكثفة على 10X - 50x تسريع إزالة اختناقات سير العمل في المعلوماتية] "—ورق أبيض لبروجنك المحدودة.<br />
* [http://align.genome.jp/ متعددة محاذاة تسلسل CLUSTALW]<br />
{{المعلوماتية الحيوية}}<br />
{{شريط بوابات|برمجيات|علم الأحياء الخلوي والجزيئي}}<br />
<br />
[[تصنيف:برمجيات معلوماتية حيوية]]<br />
[[تصنيف:علم الوراثة العرقي الحاسوبي]]<br />
[[تصنيف:علم تطور السلالات الحاسوبي]]</div>عبد العزيز