عبد العزيز: بوت: إصلاح أخطاء فحص أرابيكا من 1 إلى 104

2023-06-12T01:25:25Z

بوت: إصلاح أخطاء فحص أرابيكا من 1 إلى 104

صفحة جديدة

{{يتيمة|تاريخ=يونيو 2018}}
[[ملف:DNA-RNA D-loops, greatly exaggerated.jpg|تصغير|200بك|يسار]]
'''الحلقة د''' {{إنج|D-loop}} أو '''حلقة الإزاحة''' (displacement loop) هي بنية [[حمض نووي ريبوزي منقوص الأكسجين|دنا]] تنفصل فيها سلسلتا جزيء دنا مضاعف السلسلة لطول معين بواسطة سلسلة دنا ثالثة. [[حلقة ر|الحلقة ر]] مشابهة للحلقة د لكن تختلف عنها في كون السلسلة الثالثة سلسلة رنا بدل دنا. تسلسل قواعد السلسلة الثالثة يكون [[نيوكليوتيد مكمل|مكملا]] لإحدى السلسلتين الرئيسيتين ويترابط معها، مزيحا السلسلة المكملة الرئيسية الأخرى في تلك المنطقة، ومنه تتشكل هيئة من [[دنا ثلاثي السلاسل]]. صورة في [[نشر أكاديمي|البحث]] الذي يعرف المصطلح (حلقة د) توضح الحلقة د بشكل يشابه الحرف "D" حيث تشكل سلسلة الإزاحة حلقة على شكل حرف D.<ref name=Kasamatsu>{{استشهاد بدورية محكمة| الأخير1 = Kasamatsu | الأول1 = H.| الأخير2 = Robberson | الأول2 = D. L.| الأخير3 = Vinograd | الأول3 = J.| عنوان = A novel closed-circular mitochondrial DNA with properties of a replicating intermediate| صحيفة = Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America| المجلد = 68| العدد = 9| صفحات = 2252–2257| سنة = 1971| pmid = 5289384| pmc = 389395| doi=10.1073/pnas.68.9.2252| bibcode = 1971PNAS...68.2252K}}</ref>

تظهر حلقات د في عدة حالات خاصة منها: [[ترميم الدنا]]، [[قسيم طرفي|القسيمات الطرفية]] وفي البنيات نصف-مستقرة في جزيئات [[دنا متقدرة|دنا المتقدرة]] الدائري.
== في المتقدرة ==
أظهرت أبحاث في [[معهد كاليفورنيا للتقنية]] سنة 1971 أن دنا ال[[ميتوكندريون|متقدرة]] الدائري لخلايا في طور النمو يحوي قطعا قصيرة من ثلاث سلاسل سميت حلقة الإزاحة.<ref name=Kasamatsu/> ووُجِد أن السلسلة الثالثة هي قطعة منسوخة من [[سلسلة ثقيلة|السلسلة الثقيلة]] (أو سلسلة-H) للجزيء، التي تمت إزاحتها وتم ارتباط السلسلة الثالثة بالسلسلة الخفيفة (أو سلسلة-L)، ومنذ ذلك ظهر بأن السلسلة الثالثة هي السلسلة الابتدائية المُنتَجة بواسطة [[تضاعف الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين|تضاعف]] السلسلة الثقيلة والتي توقفت عن العمل بعد وقت قصير من بدء عملية الترجمة، حيث تتم المحافظة عليها لمدة معينة على تلك الحالة.<ref name="Doda1981">{{استشهاد بدورية محكمة| الأخير1 = Doda | الأول1 = J. N.| الأخير2 = Wright | الأول2 = C. T.| الأخير3 = Clayton | الأول3 = D. A.| عنوان = Elongation of displacement-loop strands in human and mouse mitochondrial DNA is arrested near specific template sequences| صحيفة = Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America| المجلد = 78| العدد = 10 | صفحات = 6116–6120| سنة = 1981| pmid = 6273850| pmc = 348988| doi=10.1073/pnas.78.10.6116| bibcode = 1981PNAS...78.6116D}}</ref> تظهر الحلقة د في المنطقة الرئيسية غير المشفِّرة لجزيء دنا المتقدرة في قطعة تسمى [[منطقة تحكم دنا المتقدرة|منطقة التحكم]] أو منطقة الحلقة د.

يمكن أن يحدث تضاعف الدنا المتقدرة بطريقتين مختلفتين، كلاهما يبدأ في منطقة الحلقة د.<ref name=fish>{{استشهاد بدورية محكمة| الأخير1 = Fish | الأول1 = J.| الأخير2 = Raule | الأول2 = N.| الأخير3 = Attardi | الأول3 = G.| عنوان = Discovery of a major D-loop replication origin reveals two modes of human mtDNA synthesis| صحيفة = Science| المجلد = 306| العدد = 5704| صفحات = 2098–2101| سنة = 2004| pmid = 15604407| doi = 10.1126/science.1102077 | bibcode = 2004Sci...306.2098F}}</ref> إحدى الطريقتين تستمر في مضاعفة السلسلة الثقيلة على طول جزء مهم (ثلثين مثلا) من الجزء الدائري، وبعدها يبدأ تضاعف السلسلة الخفيفة، والطريقة الثانية التي ذكرت حديثا تبدأ في منطقة مختلفة من منطقة الحلقة د ويستخدم تضاعف السلسلة-المزدوجة يكون فيه تخليق كلا السلسلتين في آن واحد.<ref name=fish/><ref name="Holt2000">{{استشهاد بدورية محكمة| الأخير1 = Holt | الأول1 = I. J.| الأخير2 = Lorimer | الأول2 = H. E.| الأخير3 = Jacobs | الأول3 = H. T.| عنوان = Coupled leading- and lagging-strand synthesis of mammalian mitochondrial DNA| صحيفة = Cell| المجلد = 100| العدد = 5| صفحات = 515–524| سنة = 2000| pmid = 10721989| doi=10.1016/s0092-8674(00)80688-1}}</ref>

بعض القواعد في منطقة الحلقة د يتم الحفاظ عليها، لكن أجزاء كبيرة منها متغيرة بشكل كبير، وقد أثبتت المنطقة أنها مفيدة لدراسة التاريخ التطوري لل[[فقاريات]].<ref name="Larizza2002">{{استشهاد بدورية محكمة| الأخير1 = Larizza | الأول1 = A.| الأخير2 = Pesole | الأول2 = G.| الأخير3 = Reyes | الأول3 = A.| الأخير4 = Sbisà | الأول4 = E.| الأخير5 = Saccone | الأول5 = C.| عنوان = Lineage specificity of the evolutionary dynamics of the mtDNA D-loop region in rodents| صحيفة = Journal of Molecular Evolution| المجلد = 54| العدد = 2| صفحات = 145–155| سنة = 2002| pmid = 11821908| doi = 10.1007/s00239-001-0063-4 }}</ref> تحتوي المنطقة على [[محفز (علم الوراثة)|محفزات]] [[نسخ (وراثة)|لنسخ]] ال[[حمض نووي ريبوزي|رنا]] من سلسلتي دنا المتقدرة، وهي مجاورة لبنية الحلقة د المتعلقة ببدء عملية مضاعفة الدنا <ref name="Chang1985">{{استشهاد بدورية محكمة| الأخير1 = Chang | الأول1 = D. D.| الأخير2 = Clayton | الأول2 = D. A.| عنوان = Priming of human mitochondrial DNA replication occurs at the light-strand promoter| صحيفة = Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America| المجلد = 82| العدد = 2| صفحات = 351–355| سنة = 1985| pmid = 2982153| pmc = 397036| doi=10.1073/pnas.82.2.351| bibcode = 1985PNAS...82..351C}}</ref>، كما أن تسلسلات الحلقة د مهمة في دراسة السرطان.<ref>{{استشهاد بدورية محكمة | الأخير1 = Akouchekian | الأول1 = M. | الأخير2 = Houshmand | الأول2 = M. | الأخير3 = Hemati | الأول3 = S. | الأخير4 = Ansaripour | الأول4 = M. | الأخير5 = Shafa | الأول5 = M. | عنوان = High Rate of Mutation in Mitochondrial DNA Displacement Loop Region in Human Colorectal Cancer | doi = 10.1007/DCR.0b013e31819acb99 | صحيفة = Diseases of the Colon & Rectum | المجلد = 52 | العدد = 3 | صفحات = 526–530 | سنة = 2009 | pmid = 19333057 | pmc = }}</ref>

وظيفة الحلقة د غير واضحة حتى الآن، لكن أبحاثا حديثة تقترح أنها تساهم في تنظيم [[نوواني]] المتقدرة.<ref name="He2007">{{استشهاد بدورية محكمة | الأخير1 = He | الأول1 = J. | الأخير2 = Mao | الأول2 = C. -C. | الأخير3 = Reyes | الأول3 = A. | الأخير4 = Sembongi | الأول4 = H. | الأخير5 = Di Re | الأول5 = M. | الأخير6 = Granycome | الأول6 = C. | الأخير7 = Clippingdale | الأول7 = A. B. | الأخير8 = Fearnley | الأول8 = I. M. | الأخير9 = Harbour | الأول9 = M. | الأخير10 = Robinson | الأول10 = A. J. | الأخير11 = Reichelt | الأول11 = S. | الأخير12 = Spelbrink | الأول12 = J. N. | الأخير13 = Walker | الأول13 = J. E. | الأخير14 = Holt | الأول14 = I. J. | عنوان = The AAA+ protein ATAD3 has displacement loop binding properties and is involved in mitochondrial nucleoid organization | صحيفة = The Journal of Cell Biology | المجلد = 176 | العدد = 2 | صفحات = 141–146 | سنة = 2007 | pmid = 17210950 | pmc = 2063933 | doi = 10.1083/jcb.200609158 }}</ref><ref name="Leslie2007">{{استشهاد بدورية محكمة | الأخير1 = Leslie | الأول1 = M. | عنوان = Thrown for a D-loop | صحيفة = The Journal of Cell Biology | المجلد = 176 | العدد = 2 | صفحات = 129a | سنة = 2007 | doi = 10.1083/jcb.1762iti3 | pmc = 2063944 }}</ref>
== في القسيمات الطرفية ==
تم سنة 199 التقرير بأن القسيمات الطرفية التي تُقبّع نهايات الكروموسومات لها نهايات تشبه [[وهق|الوهق]] وتسمى حلقة ت <ref name="Griffith1999">{{استشهاد بدورية محكمة| الأخير1 = Griffith | الأول1 = J. D.| الأخير2 = Comeau | الأول2 = L.| الأخير3 = Rosenfield | الأول3 = S.| الأخير4 = Stansel | الأول4 = R. M.| الأخير5 = Bianchi | الأول5 = A.| الأخير6 = Moss | الأول6 = H.| الأخير7 = De Lange | الأول7 = T.| عنوان = Mammalian telomeres end in a large duplex loop| صحيفة = Cell| المجلد = 97| العدد = 4| صفحات = 503–514| سنة = 1999| pmid = 10338214 | doi=10.1016/S0092-8674(00)80760-6}}</ref>، وهي حلقة من كلا سلسلتي الكروموسوم ارتبطتا في نقطة سابقا بواسطة النهاية 3' للسلسة الثالثة جاعلة إيها تشكل حلقة د، حيث يقوم بروتين مختص بالعمل على استقرار هذا الترابط. تحمي الحلقة ت التي تكتمل بحلقة د ملصقة نهاية الكروموسوم من الضرر.<ref name="Greider1999">{{استشهاد بدورية محكمة| الأخير1 = Greider | الأول1 = C. W.| عنوان = Telomeres do D-loop-T-loop| صحيفة = Cell| المجلد = 97| العدد = 4| صفحات = 419–422| سنة = 1999| pmid = 10338204| doi=10.1016/S0092-8674(00)80760-6}}</ref>
== في ترميم الدنا ==
== مراجع ==
{{مراجع|2}}
{{شريط بوابات|علم الأحياء الخلوي والجزيئي}}

[[تصنيف:حمض نووي ريبوزي منقوص الأكسجين]]
[[تصنيف:قطع نهائية]]

حلقة د - تاريخ المراجعة

عبد العزيز: بوت: إصلاح أخطاء فحص أرابيكا من 1 إلى 104